« MUST » : différence entre les versions
Aller à la navigation
Aller à la recherche
Aucun résumé des modifications |
|||
| (11 versions intermédiaires par 2 utilisateurs non affichées) | |||
| Ligne 1 : | Ligne 1 : | ||
=Accès à la grappe de calcul MUST= |
=Accès à la grappe de calcul MUST= |
||
Le cluster MUST |
Le cluster MUST (272 «cores», 2 Go par «core», machines 64 bits (avec compatibilité 32 bits)) est hébergé sur le site du LAPP d'Annecy. |
||
(old) NEWS : La migration du cluster MUST sous SL 4.5 64 bits ( équivalent RHEL4.5) est terminée. |
|||
Concernant les jobs parallèles (mpi) : |
|||
*Les compilateurs MPICH, MPICH2 OPENMPI restent disponibles |
|||
*Les binaires 32bits compilés précédemment "doivent" pouvoir tourner sous la nouvelle architecture, cependant il est recommandé de les recompiler sous la nouvelle structure afin de profiter au mieux du système. |
|||
==Documentation== |
==Documentation== |
||
#La documentation sur l'utilisation de la grille MUST peut-être trouvée à l'adresse suivante : http://lappweb.in2p3.fr/LAPP2004/Informatique/Documentation/index.php (mot-clé MUST). |
|||
Les pages wiki suivantes fournissent plusieurs types d'information : |
|||
#Des tutoriaux sont consultables sur le site http://lappagenda.in2p3.fr/cdsagenda/fullAgenda.php?ida=a0772 |
|||
* Informations générales |
|||
https://lapp.in2p3.fr/spip.php?article103 |
|||
https://wiki.lapp.in2p3.fr/Support-Applicatif/index.php/Main_Page |
|||
* Premiers pas et support : |
|||
https://wiki.lapp.in2p3.fr/Support-Applicatif/index.php/Batch_UdS |
|||
==Demande de compte== |
==Demande de compte== |
||
#Un formulaire de demande de compte peut être trouvé ici : http://lappweb.in2p3.fr/informatique/Univ_Savoie/ (remplir, faire signer par le directeur du laboratoire et envoyer par fax ou mail à l'adresse mentionnée sur le formulaire). |
#Un formulaire de demande de compte peut être trouvé ici : http://lappweb.in2p3.fr/informatique/Univ_Savoie/ (remplir, faire signer par le directeur du laboratoire et envoyer par fax ou mail à l'adresse mentionnée sur le formulaire). |
||
#Acceptation de la charte informatique du CNRS http://lappweb.in2p3.fr/informatique/CharteinformatiqueCNRS2007.pdf |
#Acceptation de la charte informatique du CNRS http://lappweb.in2p3.fr/informatique/CharteinformatiqueCNRS2007.pdf |
||
==Portage des codes== |
==Portage et exécution des codes== |
||
L'accès au cluster se fait via le portail d'entrée lappuds via (ssh ssh user_uds@ |
L'accès au cluster se fait via le portail d'entrée lappuds via (ssh ssh user_uds@lappuds2.in2p3.fr). L'utilisateur dispose d'un espace de 100Mo par défaut sur son homedir (/univ-home/user_uds), accessible en NFS sur les noeuds de calcul. Cet espace peut être augmenté à la demande moyennenant finances. |
||
*compilateurs installés : gcc - f77 standards, f90 Intel (avec librairies associées). |
*compilateurs installés : gcc - f77 standards, f90 Intel (avec librairies associées). |
||
*librairies blas - lapack, librairies de physique des particules (CLHEP en C++), ... |
*librairies blas - lapack, librairies de physique des particules (CLHEP en C++), ... |
||
*librairies de calcul |
*librairies de calcul parallèle MPICH1 - MPICH2. |
||
| ⚫ | |||
==Exécution== |
|||
Le gestionnaire PBS n'a pas de gestion des jobs suivant la quantité de ressources demmnadées mais donne une priorité aux "nouveaux utilisateurs" (statistiques d'occupation de la machine). <span style="color:#FF0000;">D'autre part, pour les tests de code (avant production), il existe une file d'attente "flash" qui permet une exécution immédiate, pour un job n'excédent pas 5 min de walltime (environ 3 min de CPU). </span> |
|||
| ⚫ | |||
==Support applicatif== |
==Support applicatif== |
||
Equipe de support applicatif : |
Equipe de support applicatif : support-uds@lapp.in2p3.fr |
||
Dernière version du 11 septembre 2020 à 09:17
Accès à la grappe de calcul MUST
Le cluster MUST (272 «cores», 2 Go par «core», machines 64 bits (avec compatibilité 32 bits)) est hébergé sur le site du LAPP d'Annecy.
(old) NEWS : La migration du cluster MUST sous SL 4.5 64 bits ( équivalent RHEL4.5) est terminée.
Concernant les jobs parallèles (mpi) :
- Les compilateurs MPICH, MPICH2 OPENMPI restent disponibles
- Les binaires 32bits compilés précédemment "doivent" pouvoir tourner sous la nouvelle architecture, cependant il est recommandé de les recompiler sous la nouvelle structure afin de profiter au mieux du système.
Documentation
Les pages wiki suivantes fournissent plusieurs types d'information :
- Informations générales
https://lapp.in2p3.fr/spip.php?article103
https://wiki.lapp.in2p3.fr/Support-Applicatif/index.php/Main_Page
- Premiers pas et support :
https://wiki.lapp.in2p3.fr/Support-Applicatif/index.php/Batch_UdS
Demande de compte
- Un formulaire de demande de compte peut être trouvé ici : http://lappweb.in2p3.fr/informatique/Univ_Savoie/ (remplir, faire signer par le directeur du laboratoire et envoyer par fax ou mail à l'adresse mentionnée sur le formulaire).
- Acceptation de la charte informatique du CNRS http://lappweb.in2p3.fr/informatique/CharteinformatiqueCNRS2007.pdf
Portage et exécution des codes
L'accès au cluster se fait via le portail d'entrée lappuds via (ssh ssh user_uds@lappuds2.in2p3.fr). L'utilisateur dispose d'un espace de 100Mo par défaut sur son homedir (/univ-home/user_uds), accessible en NFS sur les noeuds de calcul. Cet espace peut être augmenté à la demande moyennenant finances.
- compilateurs installés : gcc - f77 standards, f90 Intel (avec librairies associées).
- librairies blas - lapack, librairies de physique des particules (CLHEP en C++), ...
- librairies de calcul parallèle MPICH1 - MPICH2.
La soumission de job se fait par le gestionnaire de tâches PBS, via la commande qsub. Des exemples de scripts de soumission peuvent être trouvés ici : http://lappweb.in2p3.fr/informatique/GRID/MUST-qsub-uds1-V2.tar Le gestionnaire PBS n'a pas de gestion des jobs suivant la quantité de ressources demmnadées mais donne une priorité aux "nouveaux utilisateurs" (statistiques d'occupation de la machine). D'autre part, pour les tests de code (avant production), il existe une file d'attente "flash" qui permet une exécution immédiate, pour un job n'excédent pas 5 min de walltime (environ 3 min de CPU).
Support applicatif
Equipe de support applicatif : support-uds@lapp.in2p3.fr