« Clustering par K-means, segmentation d'image » : différence entre les versions

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= Introduction : Clustering par k-means =
= Introduction : Clustering par k-means =


Le clustering ou algorithme des k moyennes a pour but de regrouper des populations en communautés disposant de critères communs proches, jusqu'à avoir des communautés homogènes qu'on appellera cluster et qui ont pour représentant un centroïde.<br>
Le clustering ou algorithme des k moyennes a pour but de regrouper des populations en communautés disposant de critères communs proches, jusqu'à avoir des communautés homogènes qu'on appellera cluster et qui ont pour représentant un centroïde.

Pour déterminer ces clusters, on regroupera les différents éléments en fonction d'une distance. Cette notion de distance est différente en fonction des domaines d'applications.<br>
Pour déterminer ces clusters, on regroupera les différents éléments en fonction d'une distance. Cette notion de distance est différente en fonction des domaines d'applications.
Le clustering par k-means peut être utilisé pour faire de la segmentation de clientèle, du clustering en Data Mining ou encore sur des images.<br>

Le clustering par k-means peut être utilisé pour faire de la segmentation de clientèle, du clustering en Data Mining ou encore sur des images.


= Algorithme pour l'image=
= Algorithme pour l'image=


<table>
<tr>
<td>
Nous allons voir ici, comment procéder de manière théorique, pour réaliser un clustering.
Nous allons voir ici, comment procéder de manière théorique, pour réaliser un clustering.
Tout d'abord, nous devons choisir \mathbf{k} points aléatoirement, qui seront les centroïdes, et un coefficient qui nous permettra de calculer $lambda les distances.
Tout d'abord, nous devons choisir '''k''' points aléatoirement, qui seront les centroïdes, et un coefficient '''λ''' qui nous permettra de calculer les distances.


Ensuite, nous allons affecter chaque point de l'image à un cluster. Pour cela, il faut calculer la distance entre le point, et chaque k. La distance la plus courte nous permettra de déterminer quel cluster choisir.
Ensuite, nous allons affecter chaque point de l'image à un cluster. Pour cela, il faut calculer la distance entre le point, et chaque k. La distance la plus courte nous permettra de déterminer quel cluster choisir.

Un point est représenté de la manière suivante : [ x , y , r , g , b ] .
Avec x et y les coordonnées et r, g, b les composantes de couleurs.


Pour calculer la distance on utilise la formule suivante :
Pour calculer la distance on utilise la formule suivante :


<math>d = \lambda (x_1 - x_2)^2 + \lambda (y_1 - y_2)^2 + (r_1 - r_2)^2 + (g_1 - g_2)^2 + (b_1 - b_2)^2 </math>
<math>d = \lambda (x_1 - x_2)^2 + \lambda (y_1 - y_2)^2 + (r_1 - r_2)^2 + (g_1 - g_2)^2 + (b_1 - b_2)^2 </math>



Lorsque les clusters sont définis, on calcul la moyenne de chaque cluster, afin de récupérer de nouveaux centres.
Lorsque les clusters sont définis, on calcul la moyenne de chaque cluster, afin de récupérer de nouveaux centres.
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Dès que l'on obtient des centres "stable", on peut modifier l'image.
Dès que l'on obtient des centres "stable", on peut modifier l'image.
</td>

<td>[[Fichier:algorigramme.png|vignette|right|Algorigramme du Clustering par K-means]]</td>
</tr>
</table>


= Réalisation grâce à Python =
= Réalisation grâce à Python =
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import numpy as np
import numpy as np
</pre>
</pre>


== Transformation des données en tableaux ==

<pre>
def imageTab(fichier):
"""fonction qui récupère toutes les infos du fichier image, pour les convertir
en tableaux numpy."""
l = fichier.width
h = fichier.height

res = []

for x in range(0,l):
for y in range(0,h):
r,g,b = fichier.getpixel((x,y))

res += [ x, y, r, g, b]

tab = np.array(res, dtype=float)

nTab = tab.reshape(l*h,5)

return nTab


def coordonnees_alea(k, l, h, image):
"""donne k coordonnees et leurs couleurs"""
res = []
for i in range(0,k):

x = randint(0,l-1)

y = randint(0,h-1)

r,g,b = image.getpixel((x,y))
res = res + [[x, y, r, g, b]]

tab = np.array(res, dtype=float)

return tab
</pre>

== Calcul des distances ==

<pre>
def coefficiente_valeur(tab, l, h):
"""Entree : tableau numpy
Sortie : tableau numpy avec les coordonnées et les couleurs entre 0 et 1"""

tab2 = np.zeros((len(tab),5), dtype=float)
tab2[:,0] = tab[:,0] / l
tab2[:,1] = tab[:,1] / h
tab2[:,2] = tab[:,2] / 255
tab2[:,3] = tab[:,3] / 255
tab2[:,4] = tab[:,4] / 255
return tab2


def distancePoints(tab1, tab2, k, coef):
"""donne la distance en couleur entre 2 points
Entrée : deux tableaux numpy
Sortie : un tableau numpy avec les distances entre les points de l'image et les k"""

taille = len(tab1)

nTab = np.zeros((taille,k),dtype=float)

for i in range(0,taille):
for j in range(0,k):
nTab[i][j] = coef*( tab1[i][0] - tab2[j][0] )**2 + coef*( tab1[i][1] - tab2[j][1] )**2 + ( tab1[i][2] - tab2[j][2] )**2 + ( tab1[i][3] - tab2[j][3] )**2 + ( tab1[i][4] - tab2[j][4] )**2
return nTab


def distance_plus_courte(tab):
"""Entrée : tableau numpy avec les k distances pour chaque points
Sortie : tableau numpy des indices où la distance est la plus petite"""

indice = np.argmin(tab,axis=1)
return indice
</pre>

== Attribution aux clusters ==

<pre>
def kTab(k):
"""Entrée : un entier k
Sortie: un tableau de k tableaux vide"""
tab = []
for i in range(0,k):
tab = tab + [[]]
return tab


def attribution_aux_clusters(tabImage, tabIndice, k):
"""Entrée : 2 tableaux Numpy, un avec les info de l'image, et les indices des distances les plus courtes
Sortie : tableau de tableaux numpy des clusters"""

cluster = kTab(k)
for i in range(0,len(tabImage)):

indice = tabIndice[i]

cluster[indice] += [tabImage[i].tolist()]

return cluster


def clustersEnNumpy(tab,k):
"""Entrée : un tableau de tableaux de tableaux de points, un nb de cluster
Sortie : un tableau de tableaux Numpy"""

Ntab = kTab(k)

for i in range(0,k):
Ntab[i] = np.array(tab[i],dtype=float)

return Ntab
</pre>

== Nouveaux Centroïdes ==

<pre>
def NouveauxCentres(tab,k):
"""Entrée : tableau de tableaux numpy avec les coordonnées des points appartenant à un cluster
Sortie : un tableau Numpy avec les du nouveaux centres"""

Nclusters = np.zeros((k,5),dtype=float)

for i in range(0,k):

moy = ( np.sum(tab[i],axis=0) / len(tab[i]) )
moy = moy.astype(int)

Nclusters[i] = moy

return Nclusters


def calculCentres(tabImage, tabImageCoeff, tabCentre, k , l, h, coeff):
"""fonction qui reprend toutes celles précédentes, pour calculer un nouveau centre"""

coeffCentre = coefficiente_valeur(tabCentre, l , h)
distance = distancePoints(tabImageCoeff, coeffCentre,k,coeff)
indice = distance_plus_courte(distance)
clusters = attribution_aux_clusters(tabImage,indice,k)
NumpyCluster = clustersEnNumpy(clusters,k)

res = NouveauxCentres(NumpyCluster,k)

return res


def meilleurs_centres(tabImage, tabImageCoeff,k,l,h,coeff,image):
"""Entrée : 2 tableaux Numpy avec les infos de l'image (1 coefficienté et l'autre non), 3 entiers, 1 flottant et une procédure d'ouverture d'image)
Sortie : un tableau Numpy, le centre optimal du cluster"""

centre = coordonnees_alea(k, l, h, image)
nouveauCentre = calculCentres(tabImage, tabImageCoeff, centre,k,l,h,coeff)
i = 0
print("Execution en cours : 0 %")
while i < 10:
centre = nouveauCentre
nouveauCentre = calculCentres(tabImage, tabImageCoeff, centre,k,l,h,coeff)
print("Execution en cours : "+str(i+1)+"0 %")
i = i +1

return nouveauCentre
</pre>

== Modification des couleurs de l'image ==

<pre>
def change_couleur_cluster(tabCluster, tabCentre, image):
"""Entrée : tableau numpy de points d'un cluster
Sortie : zone de couleur changée"""

numpyCluster = tabCluster.astype(int)
NtabCluster = numpyCluster.tolist()

numpyCentres = tabCentre.astype(int)
NtabCentres = numpyCentres.tolist()
for i in range(0,len(NtabCluster)):

image.putpixel( (NtabCluster[i][0] , NtabCluster[i][1] ), ( NtabCentres[2], NtabCentres[3], NtabCentres[4] ) )
</pre>


== Fonction finale, le clustering ==


<pre>
<pre>
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image.close()
image.close()
</pre>
</pre>


La variable tabImage contient le résultat de la fonction imageTab(), qui renvoit un tableau numpy, avec toutes les informations de chaque points de l'image, sous la forme [ x , y , r , g , b ].
Et la variable tabImageCoeff est égal à la fonction précédente mais avec chaque valeur du tableau entre 0 et 1.

La variable centroides calcul les meilleurs centroïdes sous la forme [ x , y , r , g , b ].
Et coeffCentroides et le même tableau mais avec les valeurs coefficentées.

Les variables qui suivent, permettent de calculer les distances entre les points et les centroïdes, pour ensuite créer les clusters dans la variable clusters.

Ensuite, la boucle for permet de changer la couleur des points de chaque clusters, avec les valeurs [r,g,b] du représentant du cluster.

Pour finir, l'image modifiée est enregistrée avec un nouveau nom.


= Résultats =
= Résultats =

<table>
<tr>
<td>[[Fichier: Kowloon-small-329x216.png|vignette|left|Image originale 329 x 216 px ]]</td>
<td>[[Fichier: 10-0.0001Kowloon-small-329x216.png|vignette|right|Image modifiée : k=10, coeff = 0,0001 ]]</td>
</tr>

<tr>
<td>J'ai pu obtenir ces résultats après deux minutes environ. On constate que les détails sont les mêmes, et on obtient des couleurs différentes. Plus le coefficient est petit, plus l'image est sombre.</td>
<td>[[Fichier: 10-0.7Kowloon-small-329x216.png|vignette|right|Image modifiée : k=10, coeff = 0,7 ]]</td>
</tr>

<tr>
<td>Quand le coefficient est égale à zéro, le traitement se fait juste sur les couleurs de l'image. Le programme fait une moyenne des couleurs.</td>
<td>[[Fichier: 16-0Kowloon-small-329x216.png|vignette|right|Image modifiée : k=16, coeff = 0 ]]</td>
</tr>
</table>


<table>
<tr>
<td>[[Fichier: Canada.jpg|vignette|left|Image originale 1920 x 1080 px ]]</td>
<td>[[Fichier: 50-0.5Canada.png|vignette|right|Image modifiée : k=50, coeff = 0.5 ]]</td>
</tr>
</table>

Pour une image de cette taille, une heure de traitement a été nécessaire. On remarque que les formes principales sont les mêmes, ainsi que les couleurs. Au niveau du ciel et du lac, on peut apercevoir que l'image a été traitée.

Dernière version du 13 mai 2021 à 14:53

Etudiant : Paul AUBRY

Tuteur : Jacques-Olivier LACHAUD


Introduction : Clustering par k-means

Le clustering ou algorithme des k moyennes a pour but de regrouper des populations en communautés disposant de critères communs proches, jusqu'à avoir des communautés homogènes qu'on appellera cluster et qui ont pour représentant un centroïde.

Pour déterminer ces clusters, on regroupera les différents éléments en fonction d'une distance. Cette notion de distance est différente en fonction des domaines d'applications.

Le clustering par k-means peut être utilisé pour faire de la segmentation de clientèle, du clustering en Data Mining ou encore sur des images.

Algorithme pour l'image

Nous allons voir ici, comment procéder de manière théorique, pour réaliser un clustering. Tout d'abord, nous devons choisir k points aléatoirement, qui seront les centroïdes, et un coefficient λ qui nous permettra de calculer les distances.

Ensuite, nous allons affecter chaque point de l'image à un cluster. Pour cela, il faut calculer la distance entre le point, et chaque k. La distance la plus courte nous permettra de déterminer quel cluster choisir.

Un point est représenté de la manière suivante : [ x , y , r , g , b ] . Avec x et y les coordonnées et r, g, b les composantes de couleurs.

Pour calculer la distance on utilise la formule suivante :

Lorsque les clusters sont définis, on calcul la moyenne de chaque cluster, afin de récupérer de nouveaux centres.

On réitère les actions vus précédemment mais cette fois-ci avec les nouveaux centres.

Dès que l'on obtient des centres "stable", on peut modifier l'image.

Algorigramme du Clustering par K-means

Réalisation grâce à Python

Pour ce faire, il faut installer plusieurs bibliothèques.

  • "numpy", qui va nous servir à effectuer les calculs de manières bien plus rapide.
  • "PIL" pour le traitement des images.
from random import *
from PIL import Image
import numpy as np
def clustering(k,coef):
    """Entrée :1 entier un flottant
    Sortie : image modifiée"""
    
    image0 = Image.open("Kowloon-small-329x216.png")
    image = image0

    l = image.width
    h = image.height

    tabImage = imageTab(image)
    tabImageCoeff = coefficiente_valeur(tabImage, l, h)

    centroides = meilleurs_centres(tabImage, tabImageCoeff, k, l ,h, coef, image)
    coeffCentroides = coefficiente_valeur(centroides, l, h)

    distance = distancePoints(tabImageCoeff, coeffCentroides,k,coef)
    indice = distance_plus_courte(distance)

    clusters = attribution_aux_clusters(tabImage,indice,k)
    NumpyClusters = clustersEnNumpy(clusters,k)

    print("En cours de finalisation...")

    for i in range(0,k):
        change_couleur_cluster( NumpyClusters[i] , centroides[i] , image )
        

    image.save(str(k)+"-"+str(coef)+"Kowloon-small-329x216.png")    
    image.show()
    image0.close()
    image.close()


La variable tabImage contient le résultat de la fonction imageTab(), qui renvoit un tableau numpy, avec toutes les informations de chaque points de l'image, sous la forme [ x , y , r , g , b ]. Et la variable tabImageCoeff est égal à la fonction précédente mais avec chaque valeur du tableau entre 0 et 1.

La variable centroides calcul les meilleurs centroïdes sous la forme [ x , y , r , g , b ]. Et coeffCentroides et le même tableau mais avec les valeurs coefficentées.

Les variables qui suivent, permettent de calculer les distances entre les points et les centroïdes, pour ensuite créer les clusters dans la variable clusters.

Ensuite, la boucle for permet de changer la couleur des points de chaque clusters, avec les valeurs [r,g,b] du représentant du cluster.

Pour finir, l'image modifiée est enregistrée avec un nouveau nom.

Résultats

Image originale 329 x 216 px
Image modifiée : k=10, coeff = 0,0001
J'ai pu obtenir ces résultats après deux minutes environ. On constate que les détails sont les mêmes, et on obtient des couleurs différentes. Plus le coefficient est petit, plus l'image est sombre.
Image modifiée : k=10, coeff = 0,7
Quand le coefficient est égale à zéro, le traitement se fait juste sur les couleurs de l'image. Le programme fait une moyenne des couleurs.
Image modifiée : k=16, coeff = 0


Image originale 1920 x 1080 px
Image modifiée : k=50, coeff = 0.5

Pour une image de cette taille, une heure de traitement a été nécessaire. On remarque que les formes principales sont les mêmes, ainsi que les couleurs. Au niveau du ciel et du lac, on peut apercevoir que l'image a été traitée.